Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snap25P60879 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snap25P60879 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snap25P60879 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap25P60879 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snap25P60879 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap25P60879 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap25P60879 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap25P60879 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms