Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3eP60229 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3eP60229 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3eP60229 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3eP60229 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3eP60229 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3eP60229 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3eP60229 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3eP60229 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3eP60229 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3eP60229 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3eP60229 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3eP60229 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3eP60229 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Eif3eP60229 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3eP60229 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3eP60229 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Eif3eP60229 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms