Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcif1P59114 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms