Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms