Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc4P54775 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmc4P54775 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms