Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Map3k1P53349 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Map3k1P53349 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Map3k1P53349 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms