Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccna2P51943 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccna2P51943 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccna2P51943 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms