Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmod1P49813 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms