Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen1P49769 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psen1P49769 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psen1P49769 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psen1P49769 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psen1P49769 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psen1P49769 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Psen1P49769 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psen1P49769 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Psen1P49769 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psen1P49769 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psen1P49769 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms