Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nkx2-5P42582 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-5P42582 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms