Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hspa9P38647 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa9P38647 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hspa9P38647 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hspa9P38647 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa9P38647 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa9P38647 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa9P38647 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hspa9P38647 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa9P38647 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa9P38647 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa9P38647 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa9P38647 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa9P38647 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa9P38647 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa9P38647 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hspa9P38647 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa9P38647 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa9P38647 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms