Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpardP35396 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpardP35396 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpardP35396 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpardP35396 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpardP35396 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpardP35396 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PpardP35396 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PpardP35396 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PpardP35396 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PpardP35396 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PpardP35396 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpardP35396 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpardP35396 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpardP35396 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpardP35396 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpardP35396 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PpardP35396 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpardP35396 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpardP35396 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpardP35396 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpardP35396 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpardP35396 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpardP35396 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpardP35396 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpardP35396 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpardP35396 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpardP35396 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PpardP35396 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PpardP35396 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PpardP35396 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PpardP35396 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PpardP35396 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PpardP35396 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PpardP35396 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpardP35396 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpardP35396 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpardP35396 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PpardP35396 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpardP35396 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms