Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprmP28828 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprmP28828 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprmP28828 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprmP28828 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprmP28828 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprmP28828 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprmP28828 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprmP28828 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprmP28828 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprmP28828 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
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