Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb9P28076 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms