Protein–RNA interactions for Protein: P24860

Ccnb1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1P24860 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccnb1P24860 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1P24860 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1P24860 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms