Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd8P23463 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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