Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3P21107 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms