Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms