Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpraP18052 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpraP18052 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpraP18052 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpraP18052 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpraP18052 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtpraP18052 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpraP18052 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtpraP18052 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms