Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms