Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RhoP15409 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RhoP15409 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RhoP15409 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RhoP15409 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RhoP15409 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RhoP15409 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RhoP15409 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhoP15409 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhoP15409 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhoP15409 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhoP15409 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhoP15409 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhoP15409 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RhoP15409 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhoP15409 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms