Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FlgP11088 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FlgP11088 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FlgP11088 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FlgP11088 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FlgP11088 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FlgP11088 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FlgP11088 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FlgP11088 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FlgP11088 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FlgP11088 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FlgP11088 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FlgP11088 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FlgP11088 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FlgP11088 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FlgP11088 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FlgP11088 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FlgP11088 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FlgP11088 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FlgP11088 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FlgP11088 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FlgP11088 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FlgP11088 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FlgP11088 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FlgP11088 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FlgP11088 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FlgP11088 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FlgP11088 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FlgP11088 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FlgP11088 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FlgP11088 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FlgP11088 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FlgP11088 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FlgP11088 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FlgP11088 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FlgP11088 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FlgP11088 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FlgP11088 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms