Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lynx1P0DP60 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lynx1P0DP60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms