Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt13P08730 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt13P08730 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt13P08730 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt13P08730 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms