Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01787 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01787 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01787 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01787 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01787 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01787 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01787 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01787 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01787 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01787 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01787 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01787 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01787 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01787 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms