Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01746 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01746 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01746 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01746 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01746 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01746 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01746 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01746 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01746 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01746 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms