Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01679 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01679 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01679 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01679 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P01679 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01679 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01679 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01679 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01679 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01679 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01679 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01679 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01679 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01679 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01679 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01679 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01679 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01679 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01679 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01679 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01679 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01679 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01679 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01679 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01679 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01679 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01679 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01679 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01679 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01679 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01679 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01679 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01679 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01679 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01679 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01679 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01679 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01679 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01679 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01679 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01679 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01679 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms