Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01669 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01669 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01669 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01669 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01669 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01669 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01669 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01669 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01669 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01669 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01669 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01669 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01669 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01669 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01669 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01669 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01669 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01669 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01669 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01669 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01669 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01669 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01669 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01669 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01669 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01669 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01669 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P01669 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01669 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01669 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01669 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
P01669 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms