Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01662 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01662 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01662 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01662 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01662 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01662 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01662 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01662 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01662 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01662 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01662 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01662 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01662 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms