Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx8O88983 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx8O88983 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx8O88983 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx8O88983 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms