Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vamp4O70480 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vamp4O70480 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms