Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cer1O55233 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cer1O55233 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cer1O55233 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cer1O55233 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cer1O55233 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cer1O55233 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cer1O55233 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cer1O55233 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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