Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn5O54942 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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