Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb3O35393 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms