Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sprr3O09116 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms