Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac1O09106 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms