Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3488M0QW81 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3488M0QW81 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms