Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnabL7MTU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnabL7MTU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms