Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vwa3bJ9JI28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vwa3bJ9JI28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms