Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21976J3QNN2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21976J3QNN2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21976J3QNN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms