Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calhm3J3QMI4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm3J3QMI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Calhm3J3QMI4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms