Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930544D05RikJ3QK56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms