Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17535J3KMR8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17535J3KMR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms