Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2210016F16RikG3X8U3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms