Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmigd3G3X8R9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms