Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r167G3UW71 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms