Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NpcdF8VQB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms