Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colca2F8VPY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Colca2F8VPY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms