Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700056E22RikF7CNM6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700056E22RikF7CNM6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms