Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3443F7CCV5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3443F7CCV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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